Алемасов Н.А. Иванисенко Н.В. Ivanisenko V.A.
Молекулярно-динамическая модель для оценки влияния мутаций в белке на фенотипические признаки организма
Reporter: Алемасов Н.А.
Одной из причин такого неизлечимого нейродегенеративного заболевания как боковой амиотрофический склероз является мутация в гене SOD1, кодирующем белок SOD1 [1]. Если в SOD1 возникает мутация, то он может образовывать внутриклеточные агрегаты, которые приводят к болезни. Ранее была обнаружена слабая отрицательная корреляция стабильности мутантов SOD1 и времени жизни пациентов с данными мутациями [2]. Нами выдвинута гипотеза о том, что не только дестабилизация, но и локальная стабилизация структуры может вызывать агрегацию.
В рамках настоящей работы с помощью метода молекулярной динамики получены структурно-динамические характеристики белка SOD1 дикого типа и 38 его мутантов. Построены регрессионные модели, связывающие некоторые параметры белка и продолжительность жизни пациентов с мутациями в SOD1 (R > 0.6, p < 0.001). Сделаны предсказания для мутаций, о которых нет соответствующих сведений в литературе.
Работа выполнена при частичной финансовой поддержке Российского научного фонда (код проекта 14-44-00123).
ЛИТЕРАТУРА
1. Bosco D.A. et al. Wild-type and mutant SOD1 share an aberrant conformation and a common pathogenic pathway in ALS. // Nature Neuroscience. 2010. V. 13. iss. 11. P. 1396-1403.
2. Byström R. et al. SOD1 mutations targeting surface hydrogen bonds promote amyotrophic lateral sclerosis without reducing apo-state stability // J. Biol. Chem. 2010. V. 285. iss. 25. P. 19544-19552.
To reports list