Московский семинар по биоинформатике А. Голобордько «Polymer models of yeast S. сerevisiae genome organization»

5 April 2013, Moscow

Rubrics: Seminar | Biotechnologies

Activity URL: http://www.rtcb.iitp.ru/msb/Index.htm

Description:

Пятница, 5 апреля 2013 года, 18:00, Москва, МГУ, лабораторный корпус «Б».

Тема заседания — доклад Антона Голобордько (и Jon Matthew Belton, Geoffrey Fudenberg, Maxim Imakaev, Job Dekker, Leonid Mirny) MIT
«Polymer models of yeast S. сerevisiae genome organization» (Полимерные модели генома дрожжей S. сerevisiae)

Three-dimensional (3D) chromosomal organization impacts critical cellular processes including transcription, replication, and genomic stability. Despite the ubiquity of these challenges, recent 3C-based experiments suggest that major features of interphase chromosomal organization vary across eukaryotes.
A series of recent studies using optical and 3C-based experimental approaches [Duan et. al. 2010, Therizols et.al. 2010] have shown that at a global level the yeast genome assumes a Rabl-like conformation with the chromosomal centromeres tethered to the spindle pole body and telomeres anchored on the nuclear periphery. This is strikingly different from human genomic organization, where chromosomes have been shown to assume fractal globule conformations with domains of active and inactive chromatin [Lieberman-Aiden et. al. 2009]. In this work, we study Rabl-like chromosomal organization using molecular dynamics simulations complemented by a computationally efficient polymer lattice model.

Рабочий язык семинара — английский.

Адрес:
Москва, МГУ, лабораторный корпус «Б» (факультет биоинженерии и биоинформатики), комната 221 (2 этаж, направо по коридору).
Проезд: Станция метро Университет, автобусы 187, 260, 130, 103, 113, 661, 47 или троллейбус 34 до остановки: «Улица Менделеевская».
Схема проезда

Information source: http://elementy.ru/