Московский семинар по биоинформатике О. Вальба «New phase transition in random RNA-type matching»

5 June 2013, Moscow

Rubrics: Seminar | Biotechnologies

Activity URL: http://www.rtcb.iitp.ru/msb/Index.htm

Description:

Среда, 5 июня 2013 года, 18:00, Москва, МГУ, лабораторный корпус «Б».

Тема заседания — доклад Ольги Вальба МФТИ
«New phase transition in random RNA-type matching» (Полимерные модели генома дрожжей S. сerevisiae)

We study the fraction f of nucleotides involved in the formation of a cactus-like secondary structure of random heteropolymer RNA-like chain as a function of the number c different nucleotide species. We find, that with changing c, the secondary structures of very long random RNAs undergo a morphological transition: f=1 for c<ccr, signaling the formation of a virtually perfect «gapless» secondary structure; while f<1 for c>ccr, meaning that an imperfect structure with finite density of gaps is formed. We show that ccr lies within the interval. Using combinatorial methods we give the estimate c ccr≈2.8, which is close to numerically obtained value.

Рабочий язык семинара — русский.

Адрес:
Москва, МГУ, лабораторный корпус «Б» (факультет биоинженерии и биоинформатики), комната 221 (2 этаж, направо по коридору).
Проезд: Станция метро Университет, автобусы 187, 260, 130, 103, 113, 661, 47 или троллейбус 34 до остановки: «Улица Менделеевская».
Схема проезда

Information source: http://elementy.ru/