Московский семинар по биоинформатике И. В. Кулаковский «Шаблоны предпочтительных взаимных расстояний для комбинаций участков ДНК, связывающих факторы регуляции транскрипции»

19 May 2011, Moscow

Rubrics: Seminar | Biotechnologies

Activity URL: http://www.rtcb.iitp.ru/msb/Index.htm

Description:

Четверг, 19 мая 2011 года, 17:00, Москва, Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта, комната 309 или конференц-зал (3 этаж).

Тема заседания — доклад И. В. Кулаковского (А. А Белостоцкий, А. С. Касьянов, Ю. А. Медведева, И. А. Елисеева, В. Ю. Макеев), Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта (ФГУП ГосНИИгенетика, Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН, Институт белка РАН);
«Шаблоны предпочтительных взаимных расстояний для комбинаций участков ДНК, связывающих факторы регуляции транскрипции»

Механизмы регуляции экспрессии генов высших эукариот до сих пор недостаточно понятны. Нет четкого понимания, каким образом регуляторные модули, т. е. сегменты ДНК, содержащие характерные последовательности, специфически распознаваемые регуляторными белками, определяют формирование белкового комплекса, контролирующего экспрессию генов в специфических тканях или условиях. Одним из подходов при изучении регуляторных модулей является анализ «композитных элементов», представляющих собой комбинации участков связывания различных транскрипционных факторов, расположенные на заданных расстояниях друг от друга.
Было показано существование ряда предпочтительных расстояний локализации сайтов связывания некоторых пар транскрипционных факторов.
В данной работе мы попытались показать, что этот феномен является достаточно общим, по крайней мере для белков, задействованных в регуляции ответа на гипоксию в клетках человека. Мы предполагаем, что информация о правильном взаимном позиционировании сайтов связывания может быть использована для идентификации функциональных сайтов связывания при анализе как экспериментальных данных так и предсказаний in silico.

Рабочий язык семинара — русский.

Адрес:
Москва, ул. Вавилова, 32, Институт молекулярной биологии им. Энгельгардта (ИМБ РАН), 3-й этаж, комната 309 или конференц-зал (3 этаж).
Проезд: станция метро «Университет» или «Ленинский проспект», далее трамваями № 14 или № 39 до остановки «Ул. Ляпунова» или «Ул. Бардина».

Схема проезда:

Институт молекулярной биологии РАН (схема проезда)

Information source: http://elementy.ru/