Московский семинар по биоинформатике Павел Мазин и др. «Изменения сплайсинга в ходе развития мозга у приматов»
30 May 2011, MoscowRubrics: Seminar | Biotechnologies Activity URL: http://www.rtcb.iitp.ru/msb/Index.htmDescription:Понедельник, 30 мая 2011 года, 18:00, Москва, МГУ, лабораторный корпус «Б» (факультет биоинженерии и биоинформатики).
Тема заседания — доклад Павла Мазина, Михаила Гельфанда, Филиппа Хайтовича, ИППИ РАН и MPG-CAS Partner Institute of Computational Biology, Шанхай;
«Изменения сплайсинга в ходе развития мозга у приматов»)
За последние полтора десятка лет появилось множество математических моделей, призванных «адекватно» описывать рост сети интернет. В нашем докладе мы расскажем историю развития науки об этих моделях, приведем ряд совсем свежих результатов в области и обсудим различные практические применения подобных результатов, относящиеся к поиску и анализу данных в интернете.
Несмотря на интенсивные исследования, молекулярные механизмы, ответственные за анатомические, поведенческие и когнитивные отличия человека от его ближайших эволюционных родственников — обезьян, остаются неясными. В данной работе мы использовали методы секвенирования нового поколения, чтобы исследовать разницу в сплайсинге между человеком, шимпанзе и макакой в двух областях головного мозга (префронтальной коре и мозжечке) и двух возрастах (в новорожденных и взрослых). Мы показали, что из более чем 10 тысяч генов, экспрессирующихся на детектируемом уровне, более 12% имеют значимые различия в сплайсинге белок-кодирующих экзонов между видами, в то время как только 3,5% и 3% сплайсируются по-разному в разных областях мозга или в разных возрастах, соответственно. Интересно, что 108 генов (1,1%) меняют сплайсинг с возрастом по-разному в разных видах, и в более чем в половине из них изменения человек-специфичны. Функциональный анализ показал, что эти 108 генов обогащены функциями, связанными с развитием и регуляцией развития высшей нервной системы. Таким образом, наши результаты показывают, что альтернативный сплайсинг вовлечен в межвидовые отличия у приматов и, может быть, частично ответственен за специфичные для человека особенности в развитии и функционировании головного мозга.
Рабочий язык семинара — русский.
Адрес:
Москва, МГУ, лабораторный корпус «Б» (факультет биоинженерии и биоинформатики), комната 117 (от входа налево по коридору почти до конца).
Проезд: Станция метро Университет, автобусы 187, 260, 130, 103, 113, 661, 47 или троллейбус 34 до остановки: «Улица Менделеевская».
Схема проезда