Колпаков Ф.А. Пинтус С.С. Вертышев А. Попов Д.В.
База данных по генной экспрессии и метаболизму в скелетных мышцах
Докладчик: Колпаков Ф.А.
Нами разработана структура базы данных по изменению генной экспрессии в скелетных мышцах (RNA-seq) при различных стресс-воздействиях. Начато наполнение базы данных путем поиска информации в публично доступных баз данных GEO и SRA и ее единообразной обработки информация при помощи сценариев анализа RNA-seq данных для платформы BioUML. База данных также содержит формализованные количественные данные по метаболическим процессам в скелетных мышцах. Для работы с базой данных (поиск и просмотр информации) разработан веб-интерфейс, доступный по адресу muscle.biouml.org.
К списку докладов